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Título:
Evaluación de loci microsatelitales heterólogos y utilización de secuencias de citocromo oxidasa I micotocondrial en estudios genéticos de Pudu pudu (Artiodactyla, cervidae)
Autor:
Guzmán Riffo, Benjamín Eliecer
Profesor Patrocinante:
Riegel Schlegel, Ricardo
Grado a Optar:
Licenciado en Ciencias Biológicas
Materia:
pudu pudu; análisis genético; microsatélites
Universidad:
Universidad Austral de Chile
Facultad:
Facultad de Ciencias
Escuela:
Escuela de Ciencias
Año de Aceptación:
2007
Resumen:
El pudu (Pudu puda) es una de las especies endémicas de Chile con graves problemas de conservación, debido a que sus poblaciones se han visto fragmentadas y disminuidas por efectos antropogénicos. En esta perspectiva, se ha incrementado el interes científico por mantener la diversidad genética de esta especie propiciando así la capacidad de adaptación a nuevos ambientes. En este trabajo se evaluaron 20 loci microsatélites desarrollados en bovinos, ovinos y algunos cervidos, en 16 individuos de pudu. También se evaluó la amplificación por PCR de los genes mitocondriales Citocromo Oxidasa subunidad I (COI) y Citocromo b (Cyt b) en el genoma del pudu y además se analizó la secuencia COI mitocondrial para estudios intrapoblacionales en seis individuos de la misma especie. De los 20 microsatélites evaluados amplificaron 18 y solo tres presentaron polimorfismo con un PIC mayor a 0,5. Tanto los fragmentos de COI como Cyt b fueron amplificados en el genoma del pudu y las secuencias COI presentaron polimorfismos a nivel de individuos, diferenciando marcadamente a tres haplotipos. Los resultados obtenidos permiten concluir que los tres loci SSR polimórficos y la secuencia COI mitocondrial son potencialmente utilizables en estudios genéticos en pudu.
Abstract:
The pudu (Pudu puda) is one of the endemic species of Chile with serious problems of conservation, given its fragmented and depaupered popilations due to anthropogenic effects. In this perspective, scientific interest has increased to support the genetic diversity of this species, promoting in this way the adaptation ability to new environments. In this work, I evaluate 20 microsatellites of bovine and sheep, in 16 individuals of pudu. Also the amplification of mitochondrial genes Cytochrome Oxidase subunit I (COI) and Cytochrome b (Cyt b) in the pudu genome and the mitocondrial COI sequence was evaluated for intraspecific variation analysis in six individuals of this species. Of 20, 18 were amplified and only three presented polymorphism, with a PIC higher 0.5. Both fragments (COI and Cyt b) were amplified in the pudu genome and the COI sequences presented polymorfisms at the individual level, differentiating markedly three haplotypes. The results found here allow us to conclude that three polymorfic SSR loci and the mitochondrial COI sequences are potentially useful in genetic studies in pudu.
Palabras Clave:
pudu pudu; análisis genético; microsatélites
Editor:
Universidad Austral de Chile - Sistema de Bibliotecas - Programa Cybertesis
Formato:
text/pdf
Idioma:
es
Copyright:
Guzmán Riffo, Benjamín Eliecer
Dirección Electrónica:
http://cybertesis.uach.cl/tesis/uach/2007/fcg993e/doc/fcg993e.pdf