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Título:
Determinación de tipos citoplasmáticos y diversidad genética a nivel nuclear de la papa nativa chilena y cultivares europeos (Solanum tuberosum ssp. tuberosum)
Autor:
Grau Núñez, Pamela Beatriz
Profesor Patrocinante:
Riegel Schlegel, Ricardo
Grado a Optar:
Ingeniero Agrónomo - Licenciado en Agronomía
Materia:
papas; papas - cultivo; germoplasma; marcadores genéticos
Universidad:
Universidad Austral de Chile
Facultad:
Facultad de Ciencias Agrarias
Escuela:
Escuela de Agronomía
Año de Aceptación:
2007
Resumen:
La zona sur de Chile es considerada como subcentro de origen de la papa cultivada (S. tuberosum ssp. tuberosum), es por esta razón que en la Universidad Austral de Chile (UACh) se formó el Banco de Germoplasma. Las accesiones pertenecientes a este Banco Genético provienen de colectas realizadas principalmente en la Isla de Chiloé, y la Isla de los Chonos. Las accesiones pertenecientes a la colección de la UACh ya fueron caracterizadas molecularmente a nivel nuclear (ADN), pero no han sido caracterizadas citoplasmáticamente. El objetivo principal de esta tesis fue determinar los distintos tipos citoplasmáticos presentes en papa y relacionarlos con la diversidad del núcleo. Mediante la utilización de los marcadores PCR específicos del cloroplasto ALC1/ALC3, y los marcadores de la mitocondria ALM4/ALM5, se analizaron 129 accesiones, de un total de 249 existentes en el Banco de Germoplasma de la UACh. Fue posible encontrar cuatro tipos citoplasmáticos distintos. Las frecuencias encontradas para cada tipo citoplasmático fueron, 77.5% para el tipo citoplasmático T/β, 13.9% para W/α, 4.6% para W/β, y 3.8% para T/α. Esto concuerda con que la mayoría de las papas cultivadas poseen el citotipo T/β. por otra parte el citotipo W/α sería el característico de las especies silvestres de América, incluida la ssp. andígena. Las diversidades encontradas para las accesiones pertenecientes a cada grupo citoplasmático, fueron 72% para T/β, 69% para W/α, 83% para W/β, y 76% para T/α. Esta alta diversidad presentada por cada grupo fue acompañada por un índice de heterocigocidad que varía entre 33% y 40%. Las bajas distancias genéticas nucleares y la alta variación existente entre las accesiones presentes en cada grupo, y las existentes entre los individuos analizados, no permitieron formar una agrupación clara.
Abstract:
South Chile is considered the subcenter of origin of the potato (S. tuberosum ssp. tuberosum). Therefore, at the Universidad Austral de Chile (UACH) the gene bank was created. Accessions belonging to the gene bank come from gatherings carried out in the Islands of Chiloé and Chonos. Accessions belonging to the UACH collection have already been molecularly characterized at nuclear level (DNA), but have not been characterized cytoplasmically. The main purpose of this dissertation was to determine the different cytoplasmic types found in potato and to relate them with the diversity of the nucleus. By using specific PCR markers ALC1/ALC3 from chloroplast and ALM4/ALM5 from mytochondria, 129 accessions were analyzed from a total number of 249 existing in the germplasm bank of the UACh. It was possible to find four different cytoplasmic types. The frequencies found for each cytoplasmic type were 77.5 % for T/β cytoplasmic type, 13.9% for W/α  4.6% for W/β and 3.8% for T/α. This it agrees with that the most cultivated potato varieties have a T/β cytoplasmic type, on the other hand the W/α cytoplasmic type it would be characteristic of the wild species in South America, included the ssp. andigena . Diversities found for cytoplasmic groups were 72% for T/β, 69% for W/α, 83% for W/β, and 76% for T/α. This high diversity shown by each group included a rate of heterozygocity which varies between 33% and 40%. The low nuclear genetic distances and the high variety existing among accessions in each group and those existing among studied individuals, did not allow a clear grouping in any of the cases.
Palabras Clave:
papas; papas - cultivo; germoplasma; marcadores genéticos
Editor:
Universidad Austral de Chile - Sistema de Bibliotecas - Programa Cybertesis
Formato:
text/pdf
Idioma:
es
Copyright:
Grau Núñez, Pamela Beatriz
Dirección Electrónica:
http://cybertesis.uach.cl/tesis/uach/2007/fag774d/doc/fag774d.pdf