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Título:
Estudio comparativo de dos métodos de genotipificación para Arcobacter butzleri, Arcobacter cryaerophilus y Arcobacter skirrowii aislados de diversos reservorios biológicos
Autor:
Mansilla Carrasco, Ingrid Anicia
Profesor Patrocinante:
Fernández Jaramillo, Heriberto
Grado a Optar:
Bioquímico - Licenciado en Bioquímica
Materia:
Arcobacter; análisis comparativo; técnicas de tipificación bacteriana
Universidad:
Universidad Austral de Chile
Facultad:
Facultad de Ciencias
Escuela:
Escuela de Bioquímica
Año de Aceptación:
2006
Resumen:
El género Arcobacter (Superfamilia VI de rRNA de Proteobacteria) presenta tres especies de importancia clínica para el hombre. A. butzleri y A. cryaerophilus, han sido identificados como agentes de bacteremia y diarrea en el ser humano. La especie A. skirrowii ha sido aislada recientemente de diarrea humana. Se compara por multiplex PCR un método de extracción de DNA basado en la lisis bacteriana por calor descrito por Houf y el método propuesto en este trabajo utilizando directamente la colonia bacteriana en la reacción de amplificación, sin necesidad de extracción previa de DNA. También se estudió la eventual variabilidad génica de las cepas utilizadas. Fueron analizadas 241 cepas sospechosas de Arcobacter aisladas de muestras alimentarias de origen aviar, filtrado de mariscos bivalvos y fecas de ganado bovino y porcino, las cuales se les extrajo el DNA. El 82% de cepas analizadas correspondieron a A. butzleri, 10% a A. cryaerophilus y 8% a la mezcla de ambas especies. No fue detectada la presencia de A. skirrowii. Del total de cepas identificadas, 60 se volvieron a analizar mediante amplificación directa partir de la colonia, encontrándose un 100% de concordancia en los resultados obtenidos por ambos métodos. Este método permitiría identificar en forma rápida y a bajo costo los reservorios y rutas de transmisión de estos patógenos emergentes. El ensayo de HMA no reveló variabilidad génica entre las cepas estudiadas.
Abstract:
Genus Arcobacter, belonging to the RNA Superfamily VI of Protobactera, has threes species of clinical importance for human beings. A. butzleri and A. cryaerophilus have been isolated from bacteremia and diarrhea. A. skirrowii was isolated recently from a case of diarrhea. Two DNA extraction methods were compared by multiplex PCR. One of them based on Houf’s method and the other one proposed by us using directly the bacterial colony in amplification reaction without needing previos DNA extraction. The eventual genetic variability of the strains assayed was also studied. A total of 241 Arcorbacter suspected strains isolated from avian alimentary products, shellfish filtrates and bovine and porcine fecal material were assayed by Houf’s method. From the, 82% corresponded to A. butzleri, 10% to A. cryaerophilus and 8% to a mixture of both species. A. skirrowii was not found. From all the identifies strains, 60 were randomly selected and reanalyzed with the colony direct amplification method obtaining a 100% of concordance when compared with Houf’s method. The colony direct amplification method cold allow to identify quickly and at low cost the reservoirs and transmission routes of these emerging pathogens. The HMA assay did not reveal genetic variability among the strains under study.
Palabras Clave:
Arcobacter; análisis comparativo; técnicas de tipificación bacteriana
Editor:
Universidad Austral de Chile - Sistema de Bibliotecas - Programa Cybertesis
Formato:
text/pdf
Idioma:
es
Copyright:
Mansilla Carrasco, Ingrid Anicia
Dirección Electrónica:
http://cybertesis.uach.cl/tesis/uach/2006/fcm288e/doc/fcm288e.pdf