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Título:
Caracterización del gen Peg1 en T. barrerae y comparación de su secuencia con especies cercanas
Autor:
Conejeros Espinoza, Iván Orlando
Profesor Patrocinante:
Gallardo Narcisi, Milton Hermes
Grado a Optar:
Bioquímico - Licenciado en Bioquímica
Materia:
Tympanoctomis barrerae; epigenética; genes; ADN
Universidad:
Universidad Austral de Chile
Facultad:
Facultad de Ciencias
Escuela:
Escuela de Bioquímica
Año de Aceptación:
2006
Resumen:
La expresión diferencial de genes permite explicar como células genéticamente homogéneas se transforman en heterogéneas funcional y estructuralmente. Muchas de las diferencias a este nivel ocurren en el desarrollo y son heredadas a través de la mitosis. Las alteraciones estables de este tipo se definen como epigenéticas, ya que no implican cambios en la secuencia nucleotídica del ADN. El fenómeno epigenético de la impronta genómica involucra la metilación selectiva de un alelo que deriva en la expresión monoalélica de un gen. El gen Peg1 (MEST) es uno de los genes con impronta más ampliamente estudiados expresándose desde el alelo paterno en ratón. Dado su condición tetraploide T. barrerae (2n=102), es un excelente modelo para estudiar este fenómeno y así avanzar en la comprensión de su regulación genómica. En la presente investigación se aisló el gen Peg1 desde biblioteca genómica de T. barrerae, se amplificó y secuenció la región exón9 – intrón – exón10 en las especies relacionadas Pipanacoctomys aureus, Octomys mimax y Octodontomys gliroides. Los resultados muestran un exitoso aislamiento de extensas secuencias génicas de Peg1 desde la biblioteca genómica de T. barrerae. El análisis filogenético de las secuencias presenta consistencia con las filogenias construidas con los genes 12S y del receptor de la hormona del crecimiento (GHR). Además, las secuencias muestran una gran diferenciación entre las especies estudiadas, permitiendo agruparlas por nivel de ploidía
Abstract:
The differential expression of genes can explain how genetically homogeneous cells become heterogeneous in function and structure. Most difference at this level occurs in development and are heritable through mitosis. These kind of stable alterations are defined as epigenetics alterations, since they are heritable in the short time and do not involve DNA nucleotide sequence changes. The epigenetic phenomena of genomic imprinting involve the selective methylation of an allele which becomes monoallelic in the expression of a gene. The Peg1 (MEST) gene is well-studied imprinted gene and its expression is derived from the paternally allele in mouse. Due to it´s tetraploid condition, T. barrerae (2N=102), is an excellent biological model to study this phenomena and to understand its genomic regulation. In this investigation we isolated Peg1 from the T. barrerae´s genomic DNA library. We also amplified and sequenced the Peg1 exon9-intron9-exon10 region in the related species Pipanacoctomys aureus, Octomys mimax and Octodontomys gliroides, for phylogenetic comparisons and phylogeny construction. Data is expected to be compatible with other gene trees constructed with nuclear and mitochondrial markers frequently used. We successfully purified the vector that contains the T. barrerae´s Peg1 gene sequences. Phylogenetic analysis shows consistency with the 12S and GHR phylogenies of the octodontids. The Peg1 sequences of octodontids are fairy conserved and the species can be discriminated by ploidy level.
Palabras Clave:
Tympanoctomis barrerae; epigenética; genes; ADN
Editor:
Universidad Austral de Chile - Sistema de Bibliotecas - Programa Cybertesis
Formato:
text/pdf
Idioma:
es
Copyright:
Conejeros Espinoza, Iván Orlando
Dirección Electrónica:
http://cybertesis.uach.cl/tesis/uach/2006/fcc747c/doc/fcc747c.pdf