Información detallada Tesis (Metadatos y Resúmenes)

Título:
Caracterización molecular de aislamientos de Colletotrichum sp. causante de antracnosis en lupino (Lupinus sp. L) mediante marcadores ITS-RFLPs y RAPDs
Autor:
Véliz Vallejos, Débora Fabiola
Profesor Patrocinante:
Riegel Schlegel, Ricardo
Grado a Optar:
Ingeniero Agrónomo - Licenciado en Agronomía
Materia:
lupino; antracnosis; hongos dañinos
Universidad:
Universidad Austral de Chile
Facultad:
Facultad de Ciencias Agrarias
Escuela:
Escuela de Agronomía
Año de Aceptación:
2005
Resumen:
Actualmente la antracnosis representa una de las enfermedades más importantes y devastadoras del lupino en Chile y el mundo, llegando a ocasionar pérdidas en campo, de hasta el 50% en L. angustifolius y el 100% en L. albus. La taxonomía de los aislamientos del hongo Colletotrichum causante de antracnosis en lupino ha sido ampliamente estudiada y discutida. Algunos autores lo han descrito como Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc. y otros como Colletotrichum acutatum Simmonds ex Simmonds. Tradicionalmente los aislamientos fúngicos se han diferenciado mediante análisis morfotaxonómico. Sin embargo este análisis posee numerosas desventajas, las que han sido subsanadas, con el desarrollo de herramientas moleculares, las que a su vez han constituido un apoyo a la sistemática tradicional. Recientemente este patógeno ha sido redescrito mediante análisis de taxonomía tradicional y el uso de herramientas moleculares como una nueva especie, Colletotrichum lupini. Se plantea que los aislamientos chilenos pertenecen a otra especie y que la diversidad genética presentada por ellos es alta. En este trabajo se desarrolló una metodología, que permitió la diferenciación de las tres especies de Colletotrichum asociadas a antracnosis en lupino. Mediante marcadores moleculares ITS-RFLPs, se determinó que todos los aislamientos chilenos en estudio, pertenecen a la especie C. lupini. Marcadores moleculares RAPDs fueron utilizados para analizar la diversidad genética de 21 aislamientos colectados en la IX Región de Chile. Esta diversidad resultó ser alta, sobretodo en los aislamientos provenientes de la localidad de Cajón, los que superaron el valor de diversidad genética encontrada en la totalidad de los aislamientos estudiados. La mayoría de los aislamientos se agruparon en un grupo fenético heterogéneo, el cual presentó 12 haplotipos distintos. Los cuatro haplotipos restantes, no constituyeron grupos claramente definidos. La gran diversidad genética, el numero de haplotipos encontrados y la formación de grupos independientemente de las variedades lupini y setosum, suponen la presencia de otras variedades en los aislamientos chilenos. No se estableció una correlación entre la formación de los distintos grupos fenéticos, con el lugar geográfico de colecta y el tipo de hospedero. Este trabajo es un primer paso para el desarrollo de tolerancia y/o resistencia a antracnosis en los programas de mejoramiento genético de lupino realizados en Chile. Se requieren de futuras investigaciones de patogenicidad de los aislamientos de C. lupini y de las interacciones ecológicas entre estos y los diversos genotipos de lupino.
Abstract:
At present the anthracnose represents one of the most important and devastating diseases of the lupin in Chile and the world, causing lost in field from 50% in L. angustifolius until 100% in L. albus. The taxonomy of the fungi isolations Colletotrichum causing the anthracnose on lupin has been widely studied and discussed. Some authors have described it like Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc. and others like Colletotrichum acutatum Simmonds ex Simmonds. Traditionally the isolations have been distinguished assessed by morphotaxonomic analysis. Nevertheless this analysis has numerosus disadvantages. These have been corrected with the development of molecular tools, and these have constituted a support to the traditional sistematics. Recently this pathogen has been redescribed like a new specie, Colletotrichum lupini. It is said that Chilean isolations belong to another specie and its genetic diversity is high. In this work a methodology, that allowed the differentiation of three species of Colletotrichum associated to the anthracnose of the lupin assessed by ITS-RFLPs molecular markers, was developed. It was determined that all the Chilian isolations in study belong to specie C. lupin. Molecular markers as RAPDs were used to analyze the genetic diversity of 21 isolations collected in the IX region of Chile. This diversity was high, coverall in the isolations belonged of the locality of Cajón. These isolations surpassed the genetic diversity value founded in the totality of the studied isolations. The mayority of the isolations was grouped in a heterogeneus phenetic group, which presented 12 different haplotypes. The four remaining haplotypes did not constituted groups defined clearly. The great genetic diversity, the number of haplotypes founded and the formation of groups independently of the varieties lupini and setosum suppose the presence of other varieties in the Chilian isolations. A relationships between the formation of differents phenetics groups, with the geographic place of collect and the type of host-plant was not established. This work is a first step for the development of tolerance and/or resistance to anthracnose in the programs of genetic improvement of lupin realized in Chile. But futures researchs of the pathogenicity of C. lupini isolations and their ecological interactions with the differents genotypes of lupins will be required.
Palabras Clave:
lupino; antracnosis; hongos dañinos
Editor:
Universidad Austral de Chile - Sistema de Bibliotecas - Programa Cybertesis
Formato:
text/pdf
Idioma:
es
Copyright:
Véliz Vallejos, Débora Fabiola
Dirección Electrónica:
http://cybertesis.uach.cl/tesis/uach/2005/fav437c/doc/fav437c.pdf