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Título:
Desarrollo de un mapa de ligamiento genético en Vitis vinifera L., basado en marcadores moleculares SSR y AFLP
Autor:
Zavala Martínez, Kattina Cecilia
Profesor Patrocinante:
Hinrichsen R., Patricio
Grado a Optar:
Bioquímico - Licenciado en Bioquímica
Materia:
uva de mesa; marcadores genéticos
Universidad:
Universidad Austral de Chile
Facultad:
Facultad de Ciencias
Escuela:
Escuela de Bioquímica
Año de Aceptación:
2002
Resumen:
En el Instituto de Investigaciones Agropecuarias se ha establecido un programa de mejoramiento genético de uva de mesa (Vitis vinifera L.), la principal especie frutal de Chile. Por tratarse de una especie leñosa, la selección de individuos mejorados es lenta ya que los caracteres de interés en la fruta se manifiestan sólo cuatro a cinco años después de realizado un cruzamiento. El objetivo de esta tesis fue la construcción de un mapa de ligamiento genético para uva de mesa basado en marcadores moleculares, el que se preparó en base a 127 segregantes del cruzamiento Ruby Seedless x Thompson Seedless. Se trabajó con dos tipos de marcadores, microsatélites (SSR) y AFLP, aunque en el análisis también fueron incluidos 5 marcadores de RAPD y 1 marcador morfológico (color de la baya). En una primera etapa, se usaron cinco marcadores de SSR para confirmar la filiación de los segregantes, determinándose un 17% de plantas con patrones genéticos que no coincidían con los progenitores, correspondientes a eventos de autopolinización del cultivar madre, Ruby. Para el mapa se completó el análisis de 20 marcadores de SSR, con los cuales se identificaron 19 alelos mapeados en Ruby y 25 en Thompson. En el caso de AFLP, se analizaron 33 combinaciones de partidores, de las cuales sólo 16 fueron analizadas en la población completa, obteniéndose 47 marcadores dominantes para Ruby y 57 para Thompson. Con una estrategia de pseudoretrocruzamiento y usando el programa MapManager se obtuvo 2 mapas de ligamiento (uno para cada progenitor). Para Ruby se identificaron 16 grupos de ligamiento, cubriendo una distancia total de 525 cM. En el caso de Thompson, el mapa obtenido constó de 17 grupos de ligamiento, cubriendo una distancia total de 940 cM. Dado que la vid tiene 19 pares de cromosomas, estos mapas tienen un grado de saturación intermedio.
Abstract:
A breeding program on table grapes (Vitis vinifera L.), the main fruit crop for Chile, was established at Instituto de Investigaciones Agropecuarias. Because this is woody specie, the selection of individuals takes a long period of time, since the expression of fruit traits of interest is delayed by at least four to five years after the crossing. The main objective of this Thesis was to construct a linkage map for table grapes based on molecular markers. This was based in a 127 individuals progeny corresponding to the cross Ruby Seedless x Thompson Seedless. Two kind of markers were used, microsatellites (SSR) and AFLP, although five RAPD polymorphisms and one morphological trait (berry color) were also considered. In a first step, five SSR markers were used to confirm the correct filiation of the segregants under study. 17% of plants showed unrelated profiles to their progenitors, this result may reflect a self-pollination events of the mother cultivar, Ruby. For the mapping itself, a total of 20 SSR markers analysed revealed 19 alleles corresponding to Ruby and 25 to Thompson. In the case of AFLP, 16 out 33 primer combinations were evaluated in the hole population, obtaining 47 dominant markers for Ruby and 57 for Thompson. Based on a pseudo-testcross approach and using the MapManager statistical program, two linkage maps were obtained, one for each progenitor. In the case of Ruby, 16 linkage groups were identified, covering a total of 525 cM. For Thompson, the map was made of 17 linkage groups, covering a distance of 940 cM. Considering that grapes is a diploid specie with 19 chromosomes, these maps have an intermediate saturation level.
Palabras Clave:
uva de mesa; marcadores genéticos
Editor:
Universidad Austral de Chile - Sistema de Bibliotecas - Programa Cybertesis
Formato:
text/pdf
Idioma:
es
Copyright:
Zavala Martínez, Kattina Cecilia
Dirección Electrónica:
http://cybertesis.uach.cl/tesis/uach/2002/fcz.12d/doc/fcz.12d.pdf